Болтона звинувачують у восьми пунктах незаконного передання інформації, що стосується національної оборони, і десяти пунктах незаконного зберігання таких матеріалів.

Згідно з обвинувальним актом, у період із 9 квітня 2018 року до 22 серпня 2025 року Болтон, обіймаючи посаду радника з національної безпеки, передав понад тисячу сторінок секретної інформації про свою діяльність на посаді двом особам, які не мали дозволу на доступ до таких даних. Ці матеріали містили дані під грифом «Надзвичайно таємно».

Крім того, Болтон незаконно зберігав у своєму будинку в Меріленді документи та нотатки, що містять секретні дані, включно з інформацією оборонного характеру.

У документах, які Болтон передавав, містилися такі дані:

• розвідінформація про заплановані атаки в інших країнах;
• відомості від союзників, які ділилися чутливою інформацією з американськими спецслужбами;
• плани іноземних держав щодо запуску ракет;
• таємні операції США за кордоном;
• джерела і методи збору людської розвідки;
• інформація про наміри іноземних урядів та їхніх військових лідерів;
• докази участі певних держав у нападах проти сил США.

Серед документів, які Болтон залишив у себе вдома, також були дані про майбутні атаки, співпрацю з союзниками, плани ракетних запусків і деталі таємних розвідувальних операцій.

«Розслідування ФБР засвідчило, що Джон Болтон передавав надсекретну інформацію, використовуючи особисті онлайн-акаунти, і зберігав зазначені документи у себе вдома, що є прямим порушенням федерального законодавства», — заявив директор ФБР Каш Патель.

Він наголосив, що слідство проводили об'єктивно, без політичного тиску, і що Бюро «не зупиниться ні перед чим, щоб притягнути до відповідальності будь-кого, хто загрожує нашій національній безпеці».

Розслідування щодо нього розпочалося ще кілька років тому, але, за словами неназваного високопоставленого американського чиновника, адміністрація Байдена тимчасово його закрила «з політичних причин».

Болтон працював радником президента США Дональда Трампа з питань нацбезпеки у 2018−2019 роках.

Ще 2020 року Міністерство юстиції намагалося зупинити публікацію мемуарів Болтона Кімната, де це сталося, вважаючи, що книжка містить секретну інформацію про діяльність Білого дому, зовнішню політику та переговори з іноземними лідерами. Суд тоді дозволив публікацію, а адміністрація Байдена 2021 року повністю закрила кримінальну справу та цивільний позов проти нього.

Болтон запевняв, що після кількох місяців перевірки його рукопис не містив жодних секретних даних. У своїй книзі він жорстко критикував Трампа, звинувачуючи його у спробах отримати підтримку Китаю на виборах і в численних прорахунках.

У 2019 році Трамп звільнив Болтона зі своєї першої адміністрації через «сильні розбіжності в поглядах». Після цього Болтон неодноразово критикував президента за неправильне поводження з секретними матеріалами, що згодом, у 2022 році, стало підставою для обшуку ФБР у резиденції Трампа в Мар-а-Лаго.

Попри це, Болтон час від часу хвалив деякі дії Трампа, зокрема удар по ядерних об'єктах Ірану в червні, назвавши його «правильним і рішучим кроком». Водночас він неодноразово заявляв, що Трампу «не вистачає компетенції та характеру, щоб бути президентом».

22 серпня ФБР провело обшук у вашингтонському будинку колишнього радника Трампа з нацбезпеки Джона Болтона. За даними CNN, слідчі дії пов’язані з можливим приховуванням секретної інформації. Обшук відбувся на тлі давнього конфлікту між Болтоном і Трампом, який колись погрожував посадити його до в’язниці після публікації критичної книги про свою адміністрацію.