Новый глава Национального центра Александра Довженко работает в институции с августа 2022 года с момента назначения исполнительным директором. Тогда команда занималась упорядочением финансово-экономической деятельности и стабилизации работы института. С декабря 2024 Игорь Гладун был и.о. генерального директора.
В Минкульте также напомнили, что с сентября 2025 года Довженко-Центр имеет статус национального предприятия, таким образом позиции учреждения в профессиональном сообществе были усилены и закреплена его роль как ключевой киноархивной и культурной государственной институции.
«Команда Министерства культуры Украины и Государственного агентства Украины по вопросам кино продолжает совместную работу с руководством Центра над стратегическими инициативами по развитию, сохранению и популяризации украинского кинематографического наследия», — говорится в сообщении.
В 2022—2023 годах вокруг должности генерального директора Довженко-центра бушевал скандал. С 2021 года его возглавляла культурный менеджер Елена Гончарук.
В августе 2022 года Госкино решило реорганизовать Довженко-центр таким образом, чтобы все фильмы из коллекции и имущество предприятия было передано Государственному учреждению Научный центр кинематографии Украины, а из структуры должно было быть выделено Государственное предприятие Украинская анимационная студия, которой собирались передать все права на украинскую анимацию. Коллектив Довженко-центра выступил против этой идеи. В ноябре Госкино оставило Елену Гончарук на должности руководителя Музея кино Довженко-Центра, а временным и. о. гендиректора Довженко-центра назначило Юлию Каждан, пообещав объявить новый конкурс на должность генерального директора. Коллектив Довженко-Центра выступил с заявлением, назвав действия Госкино рейдерским захватом. СМИ обнаружили, что Юлия Каждан не имеет никакого опыта в киноотрасли, она является основательницей кинологического центра, а также предлагает консультации по гипнотерапии и психосоматике. После чего Госкино отменило назначение и объявило конкрус, который в феврале 2023 года во второй раз выиграла Елена Гончарук. Несмотря на победу в конкурсе Госкино не подписало контракт с Гончарук, СБУ провела обыски в помещении Довженко-центра, изъяв бухгалтерские документы. Коллектив Довженко-центра обратился в суд, чтобы обжаловать действия Госкино. В конце июня 2023 года Госкино отменило приказ о реорганизации, а в августе Хозяйственный суд города Киева признал приказ о реорганизации незаконным. Позже Северный апелляционный суд отменил решение Хозяйственного суда, а в ноябре 2024 года Кассационный суд отклонил право на защиту Довженко-Центра на «реогранизацию».
В феврале 2026 года новый министр культуры Украины и вице-премьер-министр Татьяна Бережена сообщила, что конфилкт между Госкино и Довженко-Центром улажен и идет поиск кандидатуры на должность гендиректора института.